Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smarca2Q6DIC0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms