Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top2bQ64511 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms