Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Taf6Q62311 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Taf6Q62311 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms