Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms