Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms