Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxj1Q61660 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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