Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CttnQ60598 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CttnQ60598 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms