Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms