Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp18Q5SSI6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms