Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms