Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc47Q505F5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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