Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1nQ497L1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms