Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Carmil2Q3V3V9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms