Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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Lrrc43Q3V0L5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc43Q3V0L5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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