Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms