Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms