Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3UPC7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms