Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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