Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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