Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zyg11bQ3UFS0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zyg11bQ3UFS0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zyg11bQ3UFS0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zyg11bQ3UFS0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms