Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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