Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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