Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gse1Q3U3C9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms