Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms