Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fubp3Q3TIX6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fubp3Q3TIX6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fubp3Q3TIX6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms