Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sppl2bQ3TD49 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sppl2bQ3TD49 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms