Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Rpusd2Q149F1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd2Q149F1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms