Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Traf3ip1Q149C2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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