Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Col19a1Q0VF58 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col19a1Q0VF58 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms