Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnnm1Q0GA42 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms