Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700061G19RikQ08EE8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms