Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox10Q04888 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms