Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox8Q04886 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sox8Q04886 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox8Q04886 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sox8Q04886 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox8Q04886 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox8Q04886 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox8Q04886 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sox8Q04886 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms