Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms