Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scg2Q03517 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms