Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms