Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RykQ01887 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RykQ01887 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RykQ01887 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RykQ01887 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RykQ01887 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RykQ01887 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RykQ01887 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms