Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VcpQ01853 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms