Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Mc1rQ01727 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms