Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms