Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms