Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pde1bQ01065 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pde1bQ01065 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Pde1bQ01065 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pde1bQ01065 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pde1bQ01065 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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