Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms