Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms