Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms