Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms