Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms