Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms