Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Usp9xP70398 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Usp9xP70398 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Usp9xP70398 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp9xP70398 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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