Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msx3P70354 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Msx3P70354 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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